MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 105775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014501	C	6	6	68	73	0 %	0 %	0 %	100 %	307149946
2	NC_014501	A	7	7	224	230	100 %	0 %	0 %	0 %	307149946
3	NC_014501	TGT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149946
4	NC_014501	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149946
5	NC_014501	TAT	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
6	NC_014501	ATC	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149946
7	NC_014501	GTC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149946
8	NC_014501	AAT	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149946
9	NC_014501	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149946
10	NC_014501	GCG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149946
11	NC_014501	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
12	NC_014501	T	6	6	748	753	0 %	100 %	0 %	0 %	307149946
13	NC_014501	GTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149946
14	NC_014501	A	6	6	922	927	100 %	0 %	0 %	0 %	307149946
15	NC_014501	AT	3	6	969	974	50 %	50 %	0 %	0 %	307149946
16	NC_014501	AG	4	8	1101	1108	50 %	0 %	50 %	0 %	307149946
17	NC_014501	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149946
18	NC_014501	AGA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149946
19	NC_014501	AG	3	6	1195	1200	50 %	0 %	50 %	0 %	307149946
20	NC_014501	GTAT	2	8	1223	1230	25 %	50 %	25 %	0 %	307149946
21	NC_014501	CGG	2	6	1281	1286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149946
22	NC_014501	A	8	8	1337	1344	100 %	0 %	0 %	0 %	307149946
23	NC_014501	CT	3	6	1354	1359	0 %	50 %	0 %	50 %	307149946
24	NC_014501	AT	3	6	1581	1586	50 %	50 %	0 %	0 %	307149947
25	NC_014501	TC	3	6	1600	1605	0 %	50 %	0 %	50 %	307149947
26	NC_014501	TAC	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149947
27	NC_014501	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	307149947
28	NC_014501	TCG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149947
29	NC_014501	TAA	2	6	1793	1798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149947
30	NC_014501	TAA	2	6	1858	1863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149947
31	NC_014501	GGC	2	6	1991	1996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149947
32	NC_014501	TTA	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
33	NC_014501	CTG	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149947
34	NC_014501	TG	3	6	2093	2098	0 %	50 %	50 %	0 %	307149947
35	NC_014501	TTC	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149947
36	NC_014501	ATT	3	9	2247	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
37	NC_014501	T	6	6	2284	2289	0 %	100 %	0 %	0 %	307149947
38	NC_014501	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	307149947
39	NC_014501	AGA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149947
40	NC_014501	ATTT	2	8	2411	2418	25 %	75 %	0 %	0 %	307149947
41	NC_014501	ATT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149947
42	NC_014501	ACA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149947
43	NC_014501	TAACT	2	10	2574	2583	40 %	40 %	0 %	20 %	307149948
44	NC_014501	T	7	7	2643	2649	0 %	100 %	0 %	0 %	307149948
45	NC_014501	GGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149948
46	NC_014501	GAT	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
47	NC_014501	GCG	2	6	2821	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149948
48	NC_014501	ATT	2	6	2831	2836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149948
49	NC_014501	CTC	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149948
50	NC_014501	CAA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149948
51	NC_014501	TCA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149948
52	NC_014501	ATTA	2	8	2955	2962	50 %	50 %	0 %	0 %	307149948
53	NC_014501	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149948
54	NC_014501	TGGG	2	8	3018	3025	0 %	25 %	75 %	0 %	307149948
55	NC_014501	TGGA	2	8	3126	3133	25 %	25 %	50 %	0 %	307149948
56	NC_014501	TGGAA	2	10	3139	3148	40 %	20 %	40 %	0 %	307149948
57	NC_014501	TGGTTT	2	12	3217	3228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149948
58	NC_014501	TGA	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
59	NC_014501	AGG	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149948
60	NC_014501	GAA	2	6	3307	3312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149948
61	NC_014501	ACA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149948
62	NC_014501	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149948
63	NC_014501	T	6	6	3506	3511	0 %	100 %	0 %	0 %	307149948
64	NC_014501	CAG	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149948
65	NC_014501	AG	3	6	3585	3590	50 %	0 %	50 %	0 %	307149948
66	NC_014501	GAT	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149948
67	NC_014501	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149949
68	NC_014501	CCT	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149949
69	NC_014501	TTA	2	6	3806	3811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149949
70	NC_014501	TGC	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149949
71	NC_014501	GTT	2	6	3861	3866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149949
72	NC_014501	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149949
73	NC_014501	CTT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
74	NC_014501	TTC	2	6	3973	3978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
75	NC_014501	CCT	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149949
76	NC_014501	TTC	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149949
77	NC_014501	TCA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149949
78	NC_014501	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149949
79	NC_014501	T	7	7	4102	4108	0 %	100 %	0 %	0 %	307149949
80	NC_014501	TCT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149950
81	NC_014501	A	6	6	4249	4254	100 %	0 %	0 %	0 %	307149950
82	NC_014501	CAC	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149950
83	NC_014501	TAAA	3	12	4378	4389	75 %	25 %	0 %	0 %	307149950
84	NC_014501	CAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149950
85	NC_014501	TAG	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149950
86	NC_014501	CAGC	2	8	4478	4485	25 %	0 %	25 %	50 %	307149950
87	NC_014501	TTC	2	6	4533	4538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149950
88	NC_014501	TAA	2	6	5273	5278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
89	NC_014501	TCA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
90	NC_014501	GAT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
91	NC_014501	GGC	2	6	5365	5370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149951
92	NC_014501	GCA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149951
93	NC_014501	TCCG	2	8	5528	5535	0 %	25 %	25 %	50 %	307149951
94	NC_014501	ATA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
95	NC_014501	TCA	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
96	NC_014501	TGT	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149951
97	NC_014501	AG	3	6	5652	5657	50 %	0 %	50 %	0 %	307149951
98	NC_014501	TCC	2	6	5771	5776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149951
99	NC_014501	TGAG	2	8	5811	5818	25 %	25 %	50 %	0 %	307149951
100	NC_014501	TAA	2	6	5860	5865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
101	NC_014501	A	6	6	5919	5924	100 %	0 %	0 %	0 %	307149951
102	NC_014501	TTGA	2	8	5966	5973	25 %	50 %	25 %	0 %	307149951
103	NC_014501	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	307149951
104	NC_014501	TTGAC	2	10	6123	6132	20 %	40 %	20 %	20 %	307149951
105	NC_014501	TAAT	2	8	6135	6142	50 %	50 %	0 %	0 %	307149951
106	NC_014501	AAATA	2	10	6146	6155	80 %	20 %	0 %	0 %	307149951
107	NC_014501	CGG	2	6	6157	6162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149951
108	NC_014501	AAT	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
109	NC_014501	AAT	2	6	6203	6208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
110	NC_014501	AACA	2	8	6209	6216	75 %	0 %	0 %	25 %	307149951
111	NC_014501	AAT	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
112	NC_014501	CTC	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149951
113	NC_014501	ATA	2	6	6369	6374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
114	NC_014501	CGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149951
115	NC_014501	CTG	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149951
116	NC_014501	AAT	2	6	6593	6598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
117	NC_014501	TTG	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149951
118	NC_014501	CCAT	2	8	6713	6720	25 %	25 %	0 %	50 %	307149951
119	NC_014501	A	7	7	6759	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	307149951
120	NC_014501	TAG	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
121	NC_014501	GAC	2	6	6803	6808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149951
122	NC_014501	TAA	2	6	6809	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
123	NC_014501	GAA	2	6	6829	6834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149951
124	NC_014501	AAATA	2	10	6839	6848	80 %	20 %	0 %	0 %	307149951
125	NC_014501	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
126	NC_014501	A	6	6	7052	7057	100 %	0 %	0 %	0 %	307149951
127	NC_014501	TAA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
128	NC_014501	AAT	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
129	NC_014501	ACA	2	6	7098	7103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149951
130	NC_014501	TTC	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149951
131	NC_014501	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
132	NC_014501	GTA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149951
133	NC_014501	CTA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149951
134	NC_014501	TTC	2	6	7304	7309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149951
135	NC_014501	TAA	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149951
136	NC_014501	TTTA	2	8	7600	7607	25 %	75 %	0 %	0 %	307149952
137	NC_014501	ATTAA	2	10	7659	7668	60 %	40 %	0 %	0 %	307149952
138	NC_014501	CAC	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149952
139	NC_014501	ATC	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149952
140	NC_014501	TTC	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149952
141	NC_014501	CTG	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149952
142	NC_014501	TCC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149952
143	NC_014501	CAC	2	6	8029	8034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149952
144	NC_014501	TAT	2	6	8062	8067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149952
145	NC_014501	GCC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149952
146	NC_014501	TTC	2	6	8303	8308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149952
147	NC_014501	CGG	2	6	8331	8336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149952
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149	NC_014501	TCC	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149952
150	NC_014501	CAT	2	6	8419	8424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149952
151	NC_014501	TTG	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149952
152	NC_014501	CGC	2	6	8542	8547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149953
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154	NC_014501	A	6	6	8591	8596	100 %	0 %	0 %	0 %	307149953
155	NC_014501	TCA	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149953
156	NC_014501	GGC	2	6	8715	8720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149953
157	NC_014501	TAA	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149953
158	NC_014501	GCA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149953
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161	NC_014501	TAAC	2	8	9093	9100	50 %	25 %	0 %	25 %	307149953
162	NC_014501	CTT	2	6	9129	9134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149953
163	NC_014501	AG	3	6	9151	9156	50 %	0 %	50 %	0 %	307149953
164	NC_014501	CCA	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149953
165	NC_014501	CTTG	2	8	9209	9216	0 %	50 %	25 %	25 %	307149953
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167	NC_014501	CAA	2	6	9243	9248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149953
168	NC_014501	AAT	2	6	9480	9485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149954
169	NC_014501	TGCC	2	8	9636	9643	0 %	25 %	25 %	50 %	307149954
170	NC_014501	CTT	3	9	9708	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149954
171	NC_014501	GCC	2	6	9721	9726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149954
172	NC_014501	TAA	3	9	9736	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149954
173	NC_014501	CTA	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149954
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177	NC_014501	TAAA	2	8	10191	10198	75 %	25 %	0 %	0 %	307149954
178	NC_014501	GCC	2	6	10262	10267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149954
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180	NC_014501	GTTT	2	8	10373	10380	0 %	75 %	25 %	0 %	307149954
181	NC_014501	ATG	2	6	10388	10393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149954
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197	NC_014501	T	6	6	11333	11338	0 %	100 %	0 %	0 %	307149955
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248	NC_014501	ACGTC	2	10	14487	14496	20 %	20 %	20 %	40 %	307149957
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250	NC_014501	TATT	2	8	14596	14603	25 %	75 %	0 %	0 %	307149957
251	NC_014501	GAA	2	6	14626	14631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149957
252	NC_014501	T	6	6	14763	14768	0 %	100 %	0 %	0 %	307149958
253	NC_014501	GCTC	2	8	14838	14845	0 %	25 %	25 %	50 %	307149958
254	NC_014501	GTA	2	6	14850	14855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149958
255	NC_014501	GAGTG	2	10	14867	14876	20 %	20 %	60 %	0 %	307149958
256	NC_014501	ATG	2	6	14877	14882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149958
257	NC_014501	CAT	2	6	14891	14896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149958
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260	NC_014501	A	6	6	15350	15355	100 %	0 %	0 %	0 %	307149958
261	NC_014501	AAC	2	6	15445	15450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149959
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394	NC_014501	CGA	2	6	24972	24977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149966
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402	NC_014501	CAT	2	6	25511	25516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149966
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424	NC_014501	ATC	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149967
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